弗赖堡前身的两支球队同于1904年成立，分别是3月成立的“Freiburger Fussballverein 04”及5月成立的“FC Schwalbe Freiburg”，两队1912年合并成立“弗赖堡体育俱乐部”（Sportclub Freiburg），同时采纳弗莱堡造币厂的刻印狮鹫头作为会徽图案。
　　球队在两次大战时代经历多次重组。自1963年德甲成立以来，弗赖堡一直都在低组别联赛载浮载沉。球队最佳成绩，不过是1993年和2003年德乙联赛冠军。
　　弗赖堡于1978年升级德乙，一直保持中游席位，于1993年获得冠军而升级德甲。升级首季获得第16位，仅以得失球差压倒同得28分的纽伦堡而免于降级。翌季成绩大跃进，获得季军。1995年首度参战欧洲联盟杯，在第一圈即以两回合累计1-2被布拉格斯拉维亚淘汰。1997年弗赖堡只能获得第17位而降级，但翌年即夺得德乙亚军回升德甲。再次在顶级联赛逗留四季，成绩最好是2000/01年赛季获得第6位，再战欧洲联盟杯，直到第三圈才被当届冠军费耶诺德淘汰，需要兼顾两条战线的弗赖堡于2002年只能排第16位降级，翌季再夺德乙冠军升级德甲，但这次只能在德甲两季，于2005年排第18位降级。回降德乙两季均只能获得第4位而未能升级，直到08/09赛季才以德乙冠军身份重返德甲。
　　2016/17赛季球队的球衣赞助商是丹麦体育品牌Hummel。